Hovedforskel: Pinocytose er absorptionen af væsker, mens fagocytose er absorptionen af faste genstande, som i det væsentlige er føde til cellen.
Både pinocytose og fagocytose er typer af endocytose. Endocytose er en proces, hvormed celler absorberer molekyler ved at opsluge dem. Disse molekyler omfatter ofte proteiner og andre stoffer, som er vigtige for cellens eksistens. Endocytoseprocessen anvendes af alle celler, da molekylerne er store polære molekyler, som ikke kan passere gennem den hydrofobe plasma- eller cellemembran.

Pinocytose er absorptionen af væsker, mens fagocytose er absorptionen af faste genstande, som i det væsentlige er føde til cellen. Næsten alle celler udfører pinocytose, men fagocytose udføres kun af specialiserede celler, der beskytter væv ved at opsluge bakterier, celleaffald og andre unormale materialer.
Pinocytose er i det væsentlige processen med at absorbere væske sammen med dets indhold i cellen. Cellen gør dette ved at danne smalle kanaler gennem membranen. Disse kanaler omgiver væsken og alt dens indhold og derefter klemmer sig ind i vesiklerne, således at væsken absorberes med succes i cellen. Molekylerne smelter derefter sammen med lysosomer for at hydrolyse eller nedbrydes. Processen med pinocytose kræver meget energi i form af adenosintrifosfat. Dette er den kemiske forbindelse, der generelt bruges som energi i de fleste celler.
Phagocytose er processen med at absorbere og indtage partikler i cellen og ved mange protester, såsom amoeba at erhverve næringsstoffer. Absorptionsprocessen ligner pinocytose, bortset fra at det absorberede stof i stedet for væske er essentielle næringsstoffer, der er omgivet af kanalen og derefter klemmer sig ind i vesikler. Næringsstoffer smeltes derefter sammen med lysosomer og nedbrydes af enzymer. Alt og alt affaldsmateriale udvises derefter fra cellen.

Phagocytose er synonymt med at spise for single-cellede organismer, men i multicellulære dyr er denne proces blevet tilpasset til at eliminere affald og affald, i modsætning til at indtage næringsstoffer og brændstof til cellulære processer. Dette gælder især for celler i immunsystemet, der bruger fagocytose til at fjerne patogener og andre celleaffald, herunder men ikke begrænset til bakterier, døde vævsceller og små mineralpartikler.
Stoffet absorberet af fagocytose kan være så stort som cellen, hvilket kræver, at cellen skaber vesikler, der er store nok til at omsætte næringsstoffer. I pinocytose er vesiklerne imidlertid meget mindre, da de kun skal omsætte væsker, som ikke har en bestemt form. Teknisk fungerer pinocytose som fagocytose, idet den eneste forskel er, at fagocytose er specifik i de stoffer, den transporterer. Dette skyldes, at fagocytose englerer hele partikler, som senere brydes ned af enzymer og absorberes i cellerne, mens pinocytose i det væsentlige absorberer allerede opløst eller nedbrudt mad.